16S rDNA其種類少,含量大,分子大小適中,存在于各種原核生物中,由多個保守區和與之相間的多個可變區組成。其中保守區為所有細菌共有,可變區因細菌而不同。鑒于此,16S rDNA已成為細菌鑒別與分類研究中常用的靶序列。
18S rDNA是真核生物基因組中編碼核糖體的基因,其與5.8S rDNA和28S rDNA基因組成一個轉錄單元,三者高度保守,適合于較高等級水平的生物群體間的系統分析。這個轉錄單元其間的間隔區為內轉錄間隔區(Internal Transcribed Spacer, ITS),包括ITS1和ITS2兩部分,由于進化相對迅速且具多態性,因而適合于等級水平較低的系統學研究。
擴增子測序是對特定長度的PCR產物進行測序,分析序列中的變異。16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNA,通過合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
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我們的優勢
成熟的測序平臺:測16S rDNA多V區、18S rDNA和ITS等高變區域,測16S單V區或雙V區
高通量、高質量測序:準確性高,反應物種的真實情況
效率高、成本低:通量大、產出數據多
標準化的分析流程:標準分析、高級分析、定制化分析
豐富的擴增子測序及分析經驗
定制化的擴增子測序方案:可根據實際需求制定個性化的擴增子測序方案
技術流程

數據分析

樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| 組織樣品 | >1.5g | ||
| 基因組DNA | ≥200ng | ≥6ng/μl | ≥ 1.8 |
| PCR產物 | ≥1μg | ≥10ng/μl |
技術參數
| 測序平臺 | 測序策略 | 數據量 | 運轉周期 |
| HiSeq MiSeq | PE250 | 根據具體項目情況而定,不低于合同約定的數據量 | 30-55個工作日 |
詢價及訂購
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參考文獻
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Cheng M, Qian L, Shen G, et al. Microbiota modulate tumoral immune surveillance in lung through a γδT17 immune cell-dependent mechanism [J]. Cancer research, 2014, 74(15): 4030-4041.
Zhao L, Wang G, Siegel P, et al. Quantitative genetic background of the host influences gut microbiomes in chickens [J]. Scientific reports, 2013, 3.





