蛋白質非標記定量技術（label-free）是通過液質聯用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析，無需使用昂貴的穩定同位素標簽做內部標準，只需分析大規模鑒定蛋白質時所產生的質譜數據，比較不同樣品中相應肽段的信號強度，從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。
技術流程
服務優勢
無需同位素標簽做內部標準，實驗耗費低。
對樣本的操作少，從而使其接近原始狀態。
不受樣品條件的限制，克服了標記定量技術在對多個樣本進行定量方面的缺陷。
對實驗操作穩定性、重復性要求高，要求至少做三次技術重復或生物重復。
同位素標記和非標記定量的比較
| 同位素標記 | 非標記定量 |
| 樣本標記同位素 | 樣本非標記 |
| 在大樣本過程中，難于追蹤蛋白豐度 | 易跟蹤蛋白豐度 |
| 低豐度蛋白識別有限 | 能夠鑒別低豐度蛋白 |
| 需提前進行二級質譜蛋白鑒定 | 可以鑒定差異后再進行二級質譜蛋白鑒定 |
| 實驗重復性高 | 實驗重復性低 |
技術平臺
Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion? Tribrid?
應用領域：
機理和調控機制研究
動態過程中機制研究
疾病標志物的篩選
用藥及預后標志物篩選
