單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism, SNP),即染色體基因組中單個核苷酸的突變而引起的 DNA 序列的多態性,它以單個堿基的顛換、轉換、插入和缺失等形式存在。作為第三代分子標記,SNP標記具有很大的發展潛力,被廣泛應用于生物、農學、醫學、生物進化等眾多領域,在分子遺傳學、藥物遺傳學、法醫學以及疾病的診斷和治療等方面發揮著重要作用。
安必奇為您提供SNP檢測技術服務,包括從實驗設計、樣本準備、位點檢測到數據分析。我們可根據您的樣本和位點的數量選擇合適的實驗方法。旨在為您的SNP分型研究提供解決方案。
一、服務項目
Taqman探針法(定性)
該方法的技術基礎是熒光定量PCR,針對染色體上的不同SNP位點分別設計PCR引物和PCR擴增。該方法不僅可以檢測某個樣本的基因型,還可以通過軟件分析出不同基因型在所有樣本中的分布圖。
技術路線
這種方法可以直接在實驗結果中讀出每個樣本中SNP的基因型(純合子XX或YY,雜合子XY),不需要再對序列進行分析,具有直觀性。Taqman探針法通常用于少量SNP位點分析,具有成本低、速度快的優點。
項目周期:3-6周
SNaPshot法測SNP
SNaPshot的原理就是只延長了一個堿基的熒光法BigDye測序,該方法在設計引物時,把不同位置的引物設計成不同的長度,然后進行SNaPshot反應后,產物通過電泳分離、五色熒光檢測、Gene mapper分析,可在一次電泳膠內檢測多個SNP位點。
技術路線
該方法主要針對中等通量的SNP分型項目,通常用于10-30個SNP位點分析。
項目周期:4-8周
MassARRAy法(定量、多位點、高通量)
Sequenom公司的MassArray質譜系統在SNP分型市場上占有重要地位,是目前市場上高性價比的中高通量SNP分型檢測系統,通過激光激發DNA分子片段,再用飛行時間來判斷片段分子量的大小。該方法已經廣泛地應用于遺傳突變檢測。
技術路線
MassARRAy法實驗設計靈活,分型結果準確性高,性價比高。可對數百至數千份樣本檢測,樣本通量從幾百到幾萬。是高性價比的中高通量SNP分型方法,適用于GWAS實驗后續驗證以及關聯分析。
項目周期:4-6周
Illumina BeadXpress法
采用Illumina公司的BeadXpress系統進行批量SNP位點檢測,可以同時檢測1-384個SNP位點,往往用于基因組芯片結果確認,適合高通量檢測。微珠芯片具有高密度、高重復性、高靈敏度、低上樣量、定制靈活等特點,極高的集成密度,從而獲得極高的檢測篩選速度,在高通量篩選時可顯著降低成本。
技術路線
項目周期:10-12周
二、送樣要求
需要提供目的SNP位點的rs號或該位點上下游各200bp的序列以及突變的類型。具體樣本要求如下:
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| 組織 | ≥50mg | ||
| 細胞 | ≥106 | ||
| 血液 | ≥1ml | ||
| gDNA | ≥20μl | ≥50ng/μl | ≥ 1.8 |
三、提供結果
? 檢測SNP的原始數據
? 數據分析結果
? 書面報告
詢價及訂購
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