全長轉錄組測序(Iso-Seq)是基于PacBio單分子實時測序技術,憑借超長讀長的優勢(平均讀長10-15Kb),可以輕松跨越從5'末端到3'-Poly A尾的完整轉錄本,無需打斷RNA分子,從而獲得高質量全長轉錄本序列。
通過全長轉錄組測序能夠更精準地得到mRNA全長序列及完整結構信息,可以對新基因及其Iso-form進行更全面的研究,克服了轉錄本二代測序拼接短、信息不完整的難題;實現對可變剪接、同源異構體、同源基因、等位基因、融合基因等精確分析。主要應用領域有比較轉錄組學、發育轉錄組學、環境轉錄組學、輔助基因組注釋、腫瘤疾病研究等。
我們的優勢
超長讀長,全面覆蓋無需拼接,獲取mRNA全長序列
高質量的數據保障
精準鑒定更多新基因和新轉錄本
豐富的項目經驗
全面的分析內容
周期短,有競爭力的價格優勢
可定制的項目設計
技術流程

數據分析
全長無參轉錄組分析
標準分析:
1. 原始數據處理
2. 全長轉錄本分析:插入片段質控、轉錄本分類、聚類與矯正
3. 轉錄本注釋:Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. 基因結構分析:可變剪切分析、SSR分析、CDS分析、LncRNA分析、基因家族分析
高級分析:
1. 參考序列比對
2. 表達水平分析
3. 差異表達分析
4. 差異表達轉錄本KEGG富集分析
5. 差異表達熱圖分析
6. 差異表達轉錄本GO富集分析
全長有參轉錄組分析
標準分析:
1. 原始數據處理
2. 全長轉錄本分析:插入片段質控、轉錄本分類、聚類與矯正、與參考基因組比對
3. 轉錄本注釋:Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. 基因結構分析:轉錄本結構注釋、可變剪切分析、SSR分析、新轉錄本預測、CDS分析、LncRNA分析、融合基因鑒定
高級分析:
1. 參考序列比對
2. 表達水平分析
3. 差異表達分析
4. 差異表達轉錄本KEGG富集分析
5. 差異表達熱圖分析
6. 差異表達轉錄本GO富集分析
7. 基因表達趨勢分析
8. 權重共表達網絡分析
9. 樣本間差異融合基因比較
樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | RIN值 |
| Total RNA | ≥5 mg | ≥300 ng/μl | ≥ 8 |
技術參數
| 測序平臺 | 文庫類型 | 數據量 | 運轉周期 |
| PacBio SMRT | ~10 Kb | 10 G/樣本 | 視具體項目情況而定 |





