宏基因組學(Metagenomics)又叫元基因組學、微生物環境基因組學。是直接從特定環境樣本中提取全部微生物的總DNA(也稱宏基因組,metagenome),對其進行高通量測序、序列組裝和基因注釋,獲得環境微生物基因組信息總和,以研究環境微生物的群落結構、物種分類、系統進化、基因功能以及代謝通路等。擺脫了傳統研究中微生物分離培養的技術限制,在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優勢,其應用滲透到各個領域, 包括醫學、農業、畜牧、環境等。
近年來,新一代測序技術(Next Generation Sequencing)的發展使研究宏基因組的方法也已經發生了變化,人們可以較快速準確的得到大量生物數據和豐富的微生物研究信息,從而成為研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。伴隨著PacBio測序平臺的問世,宏基因組學的研究又增加了一個有力的研究途徑,其長讀長、無GC偏向和無PCR擴增等優勢可以獲得更多信息,避免二代測序技術在面對復雜微生物群落時的瓶頸:因讀長短、不能跨越重復序列、高GC含量序列等,無法真正揭示菌群的復雜情況。
利用三代實時單分子測序PacBio SMRT技術,我們可以獲得更多基因組信息,更準確的物種分類,更多的物種鑒定,較為全面地刻畫微生物群落各方面的特性,可盡可能真實的還原環境中微生物群落信息,從而深入探討它們對于整個生態系統的重要意義。
我們的優勢
成熟的測序平臺:PacBio SMRT系統
高質量的數據保障
更多的物種信息
更準確的物種鑒定
前沿的分析手段
周期短,有競爭力的價格優勢
技術流程

數據分析

樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| 基因組DNA | ≥4 μg | ≥20 ng/μl | ≥ 1.8 |
| 土壤 | 10 g | ||
| 糞便 | 2~5 g | ||
| 血液 | 10 ml | ||
| 污泥/沉淀物 | 5~10 g | ||
| 水體 | 50~100 L水樣,經過0.22 um濾膜過濾,收集濾膜 |
技術參數
| 測序平臺 | 文庫類型 | 數據量 | 運轉周期 |
| PacBio SMRT | 2 K | 每個樣本1~2個SMRT Cell | 視具體項目情況而定 |





