De novo測序也叫基因組從頭測序,主要針對未知物種的基因組序列,構建不同類型的基因組DNA文庫,并進行序列測定。然后通過生物信息學的方法對測序所得到的序列進行拼接、組裝和注釋,從而獲得該物種完整的基因組序列圖譜。利用全基因組從頭測序技術,可以獲得動物、植物、細菌、以及真菌的全基因組序列,從而推進該物種的研究。
安必奇的生物信息團隊為您提供一站式的基因組de novo測序技術服務,包括從實驗設計、樣本準備、上機測序到生物信息學分析,旨在為您的基因組學提供解決方案。我們的基因組從頭測序技術服務包括:
1. 動植物基因組de novo測序
2. 細菌基因組de novo測序
3. 真菌基因組de novo測序
4. 宏基因組de novo測序
我們的優勢
平臺優勢:獲取高質量的基因組圖譜
高深度測序:準確率高
豐富的數據分析內容:標準分析、高級分析、定制化分析
豐富的基因組測序及分析經驗:已完成多項大型基因組測序項目
定制化的基因組測序方案:可根據實際需求制定個性化的基因組測序方案
技術流程

數據分析
I. 動植物基因組de novo測序數據分析

II. 細菌真菌基因組de novo測序數據分析

提供結果
比對和counts數計算
差異基因表達分析
差異轉錄本表達分析
發現新型異構體
組裝De novo轉錄組
分析基因GO功能
定制化信息分析
樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| 動物組織 | >500mg | ||
| 動物組織 | >500mg | ||
| DNA | >400μg | ≥30ng/μl | ≥ 1.8 |
技術參數
| 項目類型 | 測序平臺 | 測序策略 | 數據量 | 運轉周期 |
| 動植物基因組de novo測序 | HiSeq | PE150 | Contig N50 ≥ 20 kb Scaffold N50 ≥ 300 kb | 視具體項目情況而定 |
| 細菌基因組de novo測序 | HiSeq | PE150 | ≤30 scaffolds | 視具體項目情況而定 |
| 真菌基因組de novo測序 | HiSeq | PE150 | Scaffold N50≥300kb | 視具體項目情況而定 |
詢價及訂購
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參考文獻
Li, Ruiqiang, et al. "De novo assembly of human genomes with massively parallel short read sequencing." Genome research 20.2 (2010): 265-272.
Huang J, Zhao Y, Shiraigol W, et al. Analysis of horse genomes provides insight into the diversification and adaptive evolution of karyotype [J]. Scientific reports, 2014, 4.





