質(zhì)粒（plasmid）是細菌、酵母菌和放線菌等生物中染色體以外的DNA分子，存在于細胞質(zhì)中，具有自主復(fù)制能力。質(zhì)粒攜帶的遺傳信息能賦予宿主細菌某些生物學(xué)形狀，有利于細菌在特定的環(huán)境條件下生存，是細菌快速適應(yīng)環(huán)境變化的重要載體。種群內(nèi)的質(zhì)粒運輸產(chǎn)生的遺傳變異保證了對環(huán)境變化的適應(yīng)性。質(zhì)粒介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移不僅在抗生素抗性基因的發(fā)現(xiàn)和傳播中起著重要的作用，而且也在病原體的降解途徑和致病性決定因素的傳播中發(fā)揮著重要作用。
盡管它們很重要，技術(shù)障礙仍然限制了對質(zhì)粒的研究。質(zhì)粒基因組測序正在迅速成為一種標準方法，以增加我們對質(zhì)粒遺傳多樣性和進化史的理解。它不僅可以幫助我們定義在這些質(zhì)粒進化過程中發(fā)生的分子事件，還可以讓我們更全面地了解編碼在質(zhì)粒上的大量附屬基因。比較質(zhì)粒序列分析為質(zhì)粒的進化及其親緣關(guān)系、它們的模塊化結(jié)構(gòu)以及插入附屬基因的熱點的存在提供了依據(jù)。
我們的優(yōu)勢
已知質(zhì)粒的全面驗證
獲得質(zhì)粒全部特征
無需參考基因組
豐富的項目經(jīng)驗
全面的分析內(nèi)容
周期短，有競爭力的價格優(yōu)勢
技術(shù)流程
數(shù)據(jù)分析
原始數(shù)據(jù)質(zhì)控
基因組序列拼接與分析
質(zhì)粒序列挑選
基因組圈圖繪制
耐藥和致病性分析
個性化分析
技術(shù)參數(shù)
| 測序平臺 | 文庫類型 | 測序深度 |
| Illumina 150PE/250PE | 400~500 bp | 100X |
| PacBio SMRT | 2 K | 100X |